Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rapgef4Q9EQZ6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms