Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnn1Q9EQR3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnn1Q9EQR3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnn1Q9EQR3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnn1Q9EQR3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Kcnn1Q9EQR3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Kcnn1Q9EQR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Kcnn1Q9EQR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Kcnn1Q9EQR3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms