Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndst3Q9EQH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Ndst3Q9EQH7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndst3Q9EQH7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndst3Q9EQH7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms