Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Upf1Q9EPU0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Upf1Q9EPU0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Upf1Q9EPU0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms