Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clstn1Q9EPL2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Clstn1Q9EPL2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clstn1Q9EPL2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms