Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sil1Q9EPK6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sil1Q9EPK6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sil1Q9EPK6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sil1Q9EPK6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sil1Q9EPK6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sil1Q9EPK6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sil1Q9EPK6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sil1Q9EPK6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms