Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rp2Q9EPK2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rp2Q9EPK2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms