Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mrpl4Q9DCU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mrpl4Q9DCU6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.5 ms