Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnft1Q9DCN7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Rnft1Q9DCN7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms