Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syde1Q9DBZ9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syde1Q9DBZ9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms