Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rnf6Q9DBU5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rnf6Q9DBU5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rnf6Q9DBU5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms