Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Riok3Q9DBU3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Riok3Q9DBU3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Riok3Q9DBU3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms