Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc97Q9DBT3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc97Q9DBT3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms