Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xrn2Q9DBR1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Xrn2Q9DBR1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xrn2Q9DBR1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms