Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ftsj3Q9DBE9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms