Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SelenooQ9DBC0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SelenooQ9DBC0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms