Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Med29Q9DB91 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms