Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med27Q9DB40 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Med27Q9DB40 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Med27Q9DB40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms