Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Samd8Q9DA37 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Samd8Q9DA37 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms