Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R3

Spata9, Spermatogenesis-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata9Q9D9R3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Spata9Q9D9R3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Spata9Q9D9R3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Spata9Q9D9R3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms