Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D9

Uncharacterized protein C1orf189 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9D9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q9D9D9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
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Q9D9D9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Q9D9D9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Q9D9D9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Q9D9D9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms