Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tvp23bQ9D8T4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms