Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arfgap3Q9D8S3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Arfgap3Q9D8S3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms