Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Q6

Uncharacterized protein C11orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8Q6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q9D8Q6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D8Q6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.2 ms