Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc91Q9D8L5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc91Q9D8L5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms