Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifi35Q9D8C4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifi35Q9D8C4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ifi35Q9D8C4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.6 ms