Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Dnajc4Q9D844 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dnajc4Q9D844 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms