Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7M8

Polr2d, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2dQ9D7M8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2dQ9D7M8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Polr2dQ9D7M8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Polr2dQ9D7M8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms