Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Capns2Q9D7J7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Capns2Q9D7J7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Capns2Q9D7J7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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