Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I9

Tgm5, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 5, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm5Q9D7I9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm5Q9D7I9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm5Q9D7I9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm5Q9D7I9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tgm5Q9D7I9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tgm5Q9D7I9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tgm5Q9D7I9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms