Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Shisa5Q9D7I0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisa5Q9D7I0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms