Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gbe1Q9D6Y9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gbe1Q9D6Y9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms