Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tube1Q9D6T1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tube1Q9D6T1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tube1Q9D6T1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms