Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tubb4aQ9D6F9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tubb4aQ9D6F9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms