Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sdr42e1Q9D665 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sdr42e1Q9D665 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sdr42e1Q9D665 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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