Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccdc39Q9D5Y1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc39Q9D5Y1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms