Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cul5Q9D5V5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cul5Q9D5V5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cul5Q9D5V5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms