Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Speer4f1Q9D5Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Speer4f1Q9D5Q6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms