Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zcchc13Q9D548 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zcchc13Q9D548 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zcchc13Q9D548 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zcchc13Q9D548 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Zcchc13Q9D548 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Zcchc13Q9D548 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Zcchc13Q9D548 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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