Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Zc2hc1bQ9D534 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Zc2hc1bQ9D534 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms