Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Fam227bQ9D518 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fam227bQ9D518 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms