Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc130Q9D516 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc130Q9D516 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms