Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm3404Q9D506 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm3404Q9D506 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3404Q9D506 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms