Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4931428L18RikQ9D4S9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms