Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tubgcp4Q9D4F8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tubgcp4Q9D4F8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 416 ms