Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lmntd1Q9D4C1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lmntd1Q9D4C1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms