Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UvssaQ9D479 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
UvssaQ9D479 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UvssaQ9D479 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms