Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rsph14Q9D3W1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rsph14Q9D3W1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rsph14Q9D3W1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms