Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag1Q9D3E6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag1Q9D3E6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag1Q9D3E6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms