Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt20Q9D312 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Krt20Q9D312 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms